Скачал с сайта новый, естественно )
Ну тут несколько вариантов
1. У вас на компе каким-то образом установлено два ModPlus и установщик обновляет не тот, который вы потом проверяете. Сложно так сделать конечно, но бывает
2. Установщику не хватает прав и файлы просто не копируются. Может антивирус мешает. Но ошибок не возникает
Вы можете также скачать архив на странице Конфигуратора и распаковать его в папку ModPlus с заменой всех файлов. Естественно, надо сначала закрыть модуль автообновления.
Ну и посмотрите какие версии у фалов: