Добрый день,
подскажите можно ли как-то использовать фирменный штамп на листе (отличный от того, что использует плагин) с сохранением функционала нумератора листов и прочего?
Нет, таких возможностей не предусмотрено. Информация о том, в какие ячейки писать данные в нумерации и прочих плагинах вшита в сами плагины.
В планах подобного функционала нет, так как такие случаи - это скорее исключение из правил, а не требуемый функционал